1952 m. baletmeisterio V.Grivicko, baleto trupės vadovo ir baletmeisterio M.Moisejevo ir pedagogės K.Salnikovos-Moisejevos iniciatyva prie Vilniaus dešimtmetės muzikos mokyklos buvo atidarytas choreografijos skyrius. Baleto solistas H.Kunavičius tapo šio skyriaus vadovu. 1963 - 2001 m. choreografijos skyriui, vėliau reorganizuotam į Vilniaus baleto mokyklą, vadovavo L.Ramanauskienė-Navickytė. 2001 m. baleto mokykla reformuota į Nacionalinės M.K.Čiurlionio menų mokyklos Baleto skyrių, kuriam vadovauja žinomas Lietuvos baleto artistas Edvardas Smalakys.
Baleto skyriuje moksleiviai rengiami dirbui profesionaliuose teatruose - Nacionaliniame operos ir baleto teatre, Kauno ir Klaipėdos muzikiniuose teatruose. Lietuvos baleto meno raidą sunku įsivaizduoti be ryškiausių artistų - G.Sakalauskaitės, V.Chlebinsko, L.Bartusevičiūtės, J.Katakino, J.Valeikaitės, P.Skirmanto, Ž.Baikštytės, M.Baužio, E.Špokaitės, E.Smalakio, N.Juškos ir daugelio kitų, kurie yra baigę šią mokyklą.
Mokyklos absolventai ir moksleiviai sėkmingai dalyvauja tarptautiniuose konkursuose: 1994 m. I tarptautiniame baleto konkurse „Maja" Sankt-Peterburge Eglė Špokaitė pelnė III premiją ir bronzos medalį; 1994 m. Permės, 1995 m. Helsinkio tarptautiniuose baleto konkursuose ir 1996 m. II vietą tarptautiniame baleto ir modernaus šokio konkurse Nagojoje. E.Špokaitė užėmė I vietą suaugusiųjų grupėje. 1994 m. R.Jezerskytė tarptautiniame jaunųjų baleto artistų konkurse Lozanoje pelnė aukso medalį, 1998 m. VI tarptautiniame baleto konkurse Džeksone (JAV) suaugusiųjų grupėje iškovojo sidabro medalį, o 2000 m. Nagojoje - bronzos. E.Smalakys tarptautiniame baleto konkurse Permėje 1994 m. iškovojo II vietą, o E.Špokaitės ir E.Smalakio duetui buvo 5 įteiktas specialus V.Vasiljevo ir E.Maksimovos prizas.
1995 m. Lozanos tarptautiniame jaunųjų baleto artistų konkurse N.Beliakaitė jaunių grupėje tapo finaliste ir diplomante, 1997 m. N.Beliakaitė VIII tarptautiniame baleto konkurse Maskvoje tapo diplomante, jai taip pat įteiktas paskatinamasis diplomą už ryškiausią šiuolaikinio numerio atlikimą. 2002 m. Moros (Švedija) tarptautiniame jaunųjų baleto artistų konkurse O.Pavliukevič iškovojo III premiją, J.Dronina laimėjo II premiją, R.Pipinytė - II premiją.
2008 m. Grasse (Prancūzija) vykusiame XXI Tarptautinis klasikinio šokio konkurse I laipsnio diplomus pelnė Margarita Simonova ir Vaida Šniurevičiūtė, o Voicechas Žuromskas laimėjo II-ąją vietą - sidabro medalį ir kvietimą dirbti Karališkajame Švedijos balete. 2009 m. Vokietijoje vykusiame festivalyje-konkurse "Tanzeolymp" Grytė Dirmaitė pelnė aukso medalį.
Ryškiausiems šalies baleto solistams teikiami valstybės apdovanojimai ir teatrinės premijos: L.Bartusevičiūtei-Noreikienei, J.Katakinui, E.Špokaitei ir E.Smalakiui - Lietuvos Didžiojo kunigaikščio Gedimino ordinai, Baltijos asamblėjos meno premijos laureatu tapo M.Baužys, teatrinės "Kristoforo" premijos laureatais - A.Cholina, R.Jezerskytė, M.Baužys, E.Špokaitė, V.Chlebinskas, J.Smoriginas, Ž.Baikštytė, N.Juška, A.Daraškevičius. 2005 m. Kultūros ministerijos premijos ir atminimo ženklo “Auksinis scenos kryžius” už geriausią 2004-2005 m. sezono choreografiją laureatais tapo A.Bagdzevičienė, V.Brazdylis, A.Domeikienė, V.Kudžma, M.Levickienė ir P.Skirmantas.
Mūsų skyriaus pedagogai ir moksleiviai nuolat bendradarbiauja su Nacionaliniu operos ir baleto teatru. Moksleiviai dalyvauja teatro klasikinio repertuaro spektakliuose bei šoka specialiuose pastatymuose: L.Delibo „Kopelija” (N.Zverevo choreografija, J.Jovaišaitės, G.Sabaliauskaitės, L.Dumšaitienės, pastatymas), A.Klenickio „Beširdis" (J.Gudavičiaus choreografija), S.Prokofjevo „Petia ir vilkas" (N.Šiekštelienės choreografija), S.Prokofjevo „Pelenė" (E.Suvės choreografija), J.Juzeliūno "Archegono žemė" (A.Kondratavičiaus choreografija), F.Šopeno „Šopeniana" (A.Glazunovo aranžuotė, M.Fokino choreografija, O.Klimovič pastatymas), L.Minkaus „Pachita" (M.Petipa choreografija, J.Katakino pastatymas), Mukta Jade “Afkary ritualai” (P.Skirmanto choreografija), L.Vilkončiaus “Piteris Penas” (choreografija V.Brazdylio, A.Bagdzevičienės, A.Domeikienės, V.Kudžmos ir M.Levickienės), L.Delibes "Kopelija"(choreografija V.Brazdylio).
Šiuo metu mokyklos baleto skyriuje dirba šie baleto pedagogai: J.Vymerytė-Grencevičienė, G.Sakalauskaitė, A.Bagdzevičienė, A.Domeikienė, D.Kiršys, J.Švedai, J.Grincevičienė, J.Liaugminienė, N.Beredina, A.Semionovas, B.Tomaševičienė, P.Skirmantas, V.Brazdylis ir kiti.